Morfologiczny substrat bariery krew-mózg stanowią:
- Akomórki śródbłonka naczyń włosowatych.
- Bbłona podstawna naczyń włosowatych.
- Ckomórki śródbłonka naczyń włosowatych, błona podstawna tych naczyń i stopkowate zakończenia wypustek komórek astrocytarnych.
- Dkomórki śródbłonka naczyń włosowatych stopkowate zakończenia wypustek astrocytów.
- Ekomórki śródbłonka naczyń włosowatych i błona podstawna tych naczyń.